Ana Fark - cDNA ve Genomik DNA

Tamamlayıcı DNA (cDNA) ve genomik DNA, moleküler biyolojideki araştırma deneylerinde kullanılan iki tip DNA molekülüdür. Hem cDNA hem de genomik DNA, DNA nükleotitlerinden oluşur. cDNA, dokudan ekstrakte edilen RNA'nın ters transkripsiyonu ile üretilir. Ters transkripsiyon için kullanılan RNA türleri toplam RNA, pre-mRNA, RNA, ribozomal RNA veya tRNA olabilir. Bununla birlikte, genomik DNA hücreden doğrudan izole edilebilir. NS asıl fark cDNA ve genomik DNA arasındaki cDNA, belirli bir organizmanın transkriptomunu temsil ederken, genomik DNA, genomu temsil eder..

Kapsanan Kilit Alanlar

1. cDNA nedir - Tanım, Gerçekler, Rol 2. Genomik DNA Nedir? - Tanım, Gerçekler, Rol 3. cDNA ve Genomik DNA Arasındaki Benzerlikler Nelerdir? - Ortak Özelliklerin Anahatları 4. cDNA ve Genomik DNA Arasındaki Fark Nedir? – Temel Farklılıkların Karşılaştırılması

Anahtar Terimler: Tamamlayıcı DNA (cDNA), Genom, Genomik DNA (gDNA), Ters Transkripsiyon, RNA, Transkriptom

cDNA nedir

cDNA (tamamlayıcı DNA), baz dizileri DNA'yı tamamlayıcı olan sentetik DNA'yı ifade eder. RNA şablonlarının ters transkripsiyonundan üretilir. Toplam RNA, pre-mRNA, RNA, ribozomal RNA veya tRNA, ters transkripsiyon için kullanılabilir. Ters transkriptaz, RNA'dan cDNA üretme reaksiyonunu katalize eden enzimdir. PCR ile birleştirilmiş ters transkripsiyon, şekil l'de gösterilmektedir.

Şekil 1: PCR ile Birleştirilmiş Ters Transkripsiyon

cDNA esas olarak prokaryotik genomlarda ökaryotik genlerin klonlanmasında kullanılır. Eksonlar, proteinlerin kodlama bölgesinden oluşur. Ökaryotlarda, kodlama bölgesi intronlar tarafından kesintiye uğrar. Transkripsiyon sırasında hem intronlar hem de ekzonlar pre-mRNA'ya kodlanır. Ancak mRNA işleme sırasında, intronlar mRNA'dan çıkarılır ve eksonları bir araya getirerek olgun bir mRNA üretir. Bir organizmanın toplam mRNA'sına transkriptom denir. Bununla birlikte, prokaryotlar mRNA işleme mekanizmalarından yoksundur. Böylece mRNA, genomun yalnızca protein kodlama bölgelerini içeren cDNA'yı sentezlemek için kullanılır. Bu cDNA, genleri prokaryotlara klonlamak için kullanılır. cDNA, RNA genomunun DNA'ya dönüştürülmesi sırasında retrovirüslerde doğal olarak üretilir.

Genomik DNA nedir

Genomik DNA (gDNA) genomdaki toplam kromozomal DNA setini ifade eder. Belirli bir organizmanın toplam gen seti, genomu olarak adlandırılır. Bununla birlikte, sadece genomun genleri aktif değildir. Çoğu organizma grubu, grup içinde benzer tipte genomik DNA'ya sahiptir. Organizmanın genomu bir sonraki nesilden diğerine aktarılır. Genel olarak, genomlar çok sayıda baz çiftinden oluşur. Örnek olarak, insan genomu yaklaşık 3 milyar baz çiftinden oluşur. İnsan genomunun kromozomları şekil 2'de gösterilmiştir.

Şekil 2: İnsan Genomunun Kromozomları

Genomik DNA'da bulunan dört tip dizi; protein kodlayan genler, art arda tekrarlanan genler, tekrarlayan DNA ve aralayıcı DNA'dır. Genomik DNA moleküler biyolojide birçok deneyde kullanılmaktadır. Genomik DNA'nın izolasyonu, cDNA'nın hazırlanmasıyla karşılaştırıldığında kolaydır. Genomik DNA, klonlamada, dizilemede, genomik kitaplıkların hazırlanmasında, DNA parmak izinde, gen yapılarının incelenmesinde ve mutasyonların/anormalliklerin saptanmasında PCR şablonları olarak kullanılabilir.

cDNA ve Genomik DNA Arasındaki Benzerlikler

cDNA ve Genomik DNA Arasındaki Fark

Tanım

cDNA: cDNA, baz dizileri Genomik DNA'yı tamamlayıcı olan sentetik DNA'dır.

Genomik DNA: Genomik DNA, genomdaki toplam kromozomal DNA setidir.

Temsil etmek

cDNA: cDNA, transkriptomu temsil eder.

Genomik DNA: DNA genomu temsil eder.

Sentezlenmiş/Çıkarılmış

cDNA: cDNA, farklı RNA türlerinin ters transkripsiyonundan sentezlenir.

Genomik DNA: Genomik DNA, mevcut genomlardan ekstrakte edilebilir.

İçerik

cDNA: cDNA, eksonlardan veya kodlama bölgelerinden oluşur.

Genomik DNA: Genomik DNA, bir organizmanın kodlayan ve kodlamayan dizilerinden oluşur.

Miktar

cDNA: cDNA birkaç baz çifti içerir.

Genomik DNA: Genomik DNA çok sayıda baz çifti içerir.

Kullanmak

cDNA: cDNA, cDNA kitaplıkları üretmek için kullanılır.

Genomik DNA: Genomik DNA, genomik kütüphaneler üretmek için kullanılabilir.

Çözüm

cDNA ve genomik DNA, moleküler biyolojide çeşitli deney türlerinde kullanılan iki tip DNA molekülüdür. cDNA, RNA'dan sentezlenir ve sadece ekzonlardan oluşur. Bu nedenle, bir organizmanın transkriptomunu temsil eder. Genomik DNA, hücrenin çekirdeğinden kolaylıkla elde edilebilir. Hem kodlayan hem de kodlamayan bölgelerden oluşur. Belirli bir organizmanın genomunu temsil eder. CDNA ve genomik DNA arasındaki temel fark, her bir DNA molekülü türünde bulunan DNA türüdür.

Referans:

1. “CDNA (Tamamlayıcı DNA).” İnsan Genleri, Burada Bulunmaktadır.2. “GDNA – Genomik DNA | Gelişmiş Analitik (AATI).” Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), Buradan ulaşabilirsiniz.3. “Genomik DNA İzolasyonu ve Uygulamaları.” Scribd, Burada mevcut.

Görünüm inceliği:

1. "Ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu" Jpark623 tarafından - Commons Wikimedia2 aracılığıyla kendi çalışmanız (CC BY-SA 3.0). Commons Wikimedia aracılığıyla "İnsan genomundan genlere" (CC BY 2.0)