NS asıl fark koloni ve plak hibridizasyonu arasındaki koloni hibridizasyonu, istenilen genlere sahip bakteri kolonilerinin seçiminde kullanılan yöntem iken, plak hibridizasyonu, istenen genlere sahip fajların seçim yöntemidir. Ayrıca, koloni hibridizasyonu, plazmit veya kozmit tabanlı kütüphanelerin taranmasında kullanılabilirken, plak hibridizasyonu faj kütüphanelerinin taranmasında kullanılabilir.

Koloni ve plak hibridizasyonu, genomik veya cDNA kitaplıklarının taranmasında kullanılan iki tekniktir. Onlar da denir koloni kaldırma ve plak kaldırma sırasıyla.

Koloni, Koloni Hibridizasyonu, Kütüphane Taraması, Plak, Plak Hibridizasyonu

Koloni Hibridizasyonu Nedir?

Koloni hibridizasyonu, istenilen DNA dizisine sahip bakteri kolonilerinin seçiminde kullanılan bir tarama yöntemidir. Ayrıca denir koloni lekesi hibridizasyonu, koloni kaldırma veya çoğaltma kaplama. Yüksek yoğunluklu kaplanmış kolonilerin taranmasını sağlar. Orijinal koloni hibridizasyonu prosedürü ilk olarak Grunstein ve Hogness tarafından geliştirilmiştir. İlk olarak, bakteri kolonileri bir zara dönüştürülebilir ve bakteri kolonileri parçalanarak nükleik asitleri açığa çıkarır. Daha sonra açığa çıkan nükleik asitler, denatüre edilerek zar üzerine sabitlenir ve radyoaktif problarla hibridize edilir.

Şekil 1: Koloni Hibridizasyon Yöntemi

Koloni, aseksüel üreme yoluyla tek bir bakteri hücresinden geliştirilen bir bakteri kümesidir. Bu nedenle, belirli bir kolonideki tüm bakteri hücreleri, dönüştürülmüş genetik materyalin yanı sıra aynı genetik yapıya sahiptir. Genel olarak, bakteriler plazmit veya kozmid vektörlerin yardımıyla dönüştürülür.

Plak Hibridizasyonu Nedir?

Plak hibridizasyonu, rekombinant fajlar için tarama yöntemidir. 1977 yılında Benton ve Devis tarafından koloni hibridizasyonunun bir modifikasyonudur. plak kaldırma. Plak hibridizasyon prosedürü, koloni hibridizasyon prosedürüne benzer ve plaklar bir nitroselüloz membrana temas ettirilerek kaldırılır. Nükleik asitler daha sonra açığa çıkarılır ve istenen problarla hibritlenerek zara sabitlenir.

Şekil 2: Agar Plakasındaki Plaklar

Plak, belirli bir bakteriyofaj tarafından o bölgedeki bakteri hücrelerinin parçalanmasıyla üretilen bir agar plakası üzerindeki berrak bir bölgedir. Nitroselüloz zarına aktarılan daha az miktarda DNA nedeniyle, plak hibridizasyonu daha az arka plan sinyali üretir.

Koloni ve Plak Hibridizasyonu Arasındaki Benzerlikler

Koloni ve Plak Hibridizasyonu Arasındaki Fark

Tanım

Koloni hibridizasyonu, istenen genlere sahip bakteri kolonilerinin seçilmesine yönelik bir yöntemi ifade ederken, plak hibridizasyonu, rekombinant fajların tanımlanmasında kullanılan bir tarama yöntemini ifade eder.

Tarafından geliştirilmiş

Koloni hibridizasyonu ilk olarak Grunstein ve Hogness tarafından, plak hibridizasyonu ilk olarak 1977'de Benton ve Devis tarafından geliştirilmiştir.

Kütüphane Türleri

Koloni hibridizasyonu, plazmit veya kozmit bazlı kütüphanelerin tanımlanmasını içerirken plak hibridizasyonu, faj kütüphanelerinin tanımlanmasını içerir.

Asansör Sayısı

Koloniler tek seferde kaldırılabilirken plaklar birkaç kez kaldırılabilir.

Arka Plan Sinyalleri

Çözüm

Koloni hibridizasyonu, plazmit veya kozmit vektörleri ile üretilen kütüphanelerdeki bakteri kolonilerinin bir tarama yöntemidir. Öte yandan, plak hibridizasyonu, faj kitaplıklarındaki bakteriyofajların bir tarama yöntemidir. Koloni ve plak hibridizasyonu arasındaki temel fark, her yöntemde taranan kitaplıkların türüdür.

Referans:

1. Kaksonen, Anna. “Mikrobiyal Topluluk Analizi için Moleküler Yaklaşımlar.” Sızdırma – BioMineWiki, 20 Nisan 2006, Buradan ulaşılabilir2. Dale, JW ve PJ Greenaway. "Plak Hibridizasyonu ile Rekombinant Fajların Tanımlanması." Moleküler Biyolojide Yöntemler (Clifton, N.J.), U.S. National Library of Medicine, Burada Bulunmaktadır

Görünüm inceliği:

1. “Leke Hibridizasyonu” Kaksonen tarafından – http://wiki.biomine.skelleftea.se/biomine/molecular/index_22.htm (Kamusal Alan) Commons Wikimedia aracılığıyla 2. “M. smegmatis plaketi” Wazzzup7up tarafından - Commons Wikimedia aracılığıyla kendi çalışmanız (Public Domain)