Ana Fark - DNA Polimeraz 1 vs 3

DNA polimeraz 1 ve 3, prokaryotik DNA replikasyonunda yer alan iki tip DNA polimerazdır. DNA polimerazlar, nükleotidleri ana zincire birleştirerek yeni bir DNA zincirinin sentezine yardımcı olur. Hem DNA polimeraz 1 hem de 3, 5' ila 3' yönünde replikatif aktiviteye sahiptir. DNA polimeraz 1, hem 5' ila 3' hem de 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesine sahiptir. Bununla birlikte, DNA polimeraz 3 sadece 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesine sahiptir. NS asıl fark DNA polimeraz 1 ve 3 arasındaki DNA polimeraz 1, fragmanlardan primerlerin çıkarılmasında ve boşluğun ilgili nükleotidlerle değiştirilmesinde yer alırken, DNA polimeraz 3 esas olarak önde gelen ve gecikmeli ipliklerin sentezinde yer alır..

Kapsanan Kilit Alanlar

1. DNA Polimeraz 1 Nedir? - Tanım, Yapı, İşlev 2. DNA Polimeraz 3 Nedir? - Tanım, Yapı, İşlev 3. DNA Polimeraz 1 ve 3 Arasındaki Benzerlikler Nelerdir? - Ortak Özelliklerin Anahatları 4. DNA Polimeraz 1 ve 3 Arasındaki Fark Nedir? – Temel Farklılıkların Karşılaştırılması

Anahtar Terimler: DNA Polimeraz 1, DNA Polimeraz 3, 3' ila 5' Ekzonükleaz Aktivitesi, 5' ila 3' Eksonükleaz Aktivitesi, Boşluk Doldurma, Klenow Fragmenti, Polimerizasyon, Düzeltme, Prokaryotik DNA Replikasyonu

DNA Polimeraz 1 Nedir?

DNA polimeraz 1, polimerizasyon aktivitesine, düzeltme okuma aktivitesine ve primer çıkarma aktivitesine sahip bir DNA polimeraz türüdür. DNA polimeraz 1 ilk olarak 1956'da Arthur Kornberg tarafından keşfedildi. Bu buluşu için 1959'da Nobel Ödülü'ne layık görüldü. DNA polimeraz 1, polA geni tarafından kodlanır. polA geninin boyutu 3000 bp'dir. DNA polimeraz 1, 5' ila 3' yönünde yeni bir DNA zincirinin sentezine yardımcı olduğu için prokaryotik DNA replikasyonunda yer alır. Ayrıca, DNA polimeraz 1, boşlukları doldurma, onarım ve rekombinasyonda yer alır. DNA polimeraz 1 enzimi, DNA onarımında önemli olan çift sarmallı DNA'daki boşlukları doldurur. DNA polimeraz 1, hem 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesine hem de 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesine sahiptir. 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesi, hem tek hem de çift sarmallı DNA'yı 5' ila 3' yönünde bozar. 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesi, DNA polimeraz 1 holoenziminden çıkarıldığında, kalan moleküle denir. Klenow parçası.

Şekil 1: DNA polimeraz 1'in fonksiyonel alanları

Klenow fragmanı, DNA amplifikasyon reaksiyonlarında faydalı bir moleküldür. Bu önemli yanlış eşleşme tamiri. DNA polimeraz 1'in üç fonksiyonel alanı, şekil 1'de gösterilmiştir.

DNA Polimeraz 3 Nedir?

DNA polimeraz 3, prokaryotik DNA replikasyonunda yer alan ana enzimdir. DNA polimeraz 3, büyüyen zincire 3' ucunda yeni nükleotitlerin eklendiği 5' ila 3' polimerizasyon aktivitesine sahiptir. Enzim, gelen nükleotidlerin şablon iplikle baz eşleşmesine yardımcı olur. DNA polimeraz 3'ün diğer işlevi, kopyalanmış DNA'yı yeniden okumaktır. DNA polimeraz 3, 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesine sahiptir. Bu nedenle, bu enzim yeni eklenen nükleotidleri okur ve şablon iplikle herhangi bir uyumsuzluk varsa, çıkarılacak ve yeniden sentezlenecektir. Bu nedenle, DNA polimeraz 3, genomun stabilitesinin korunmasında önemlidir.

Şekil 2: DNA polimeraz 3

DNA polimeraz 3 holoenzimleri, iki DNA polimeraz halinde düzenlenmiş on alt birimden oluşur. α alt birimi katalitik alt birimdir. ε alt birimi 3' ila 5' düzeltme okuma etkinliğine sahiptir. θ alt biriminin bilinmeyen bir işlevi vardır. α alt birimi, dnaE geni tarafından kodlanır. ε ve θ alt birimleri, dnaQ ve holE genleri tarafından kodlanır. DNA polimeraz 3'ün yapısı şekil 2'de gösterilmiştir.

DNA Polimeraz 1 ve 3 Arasındaki Benzerlikler

DNA Polimeraz 1 ve 3 Arasındaki Fark

Tanım

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1, polA geni tarafından kodlanan bir DNA polimerazdır ve prokaryotik DNA replikasyonunda yer alır.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3, prokaryotik DNA replikasyonuna yardımcı olan ana enzimdir.

keşif

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1 ilk olarak 1956'da Arthur Kornberg tarafından keşfedildi.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3 ilk olarak 1970 yılında Thomas Kornberg ve Malcolm Gefer tarafından keşfedildi.

Tarafından kodlanan

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1, polyA geni tarafından kodlanır.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3, dnaE, dnaQ ve holE genleri tarafından kodlanır.

Aile

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1, DNA polimeraz ailesi A'ya aittir.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3, DNA polimeraz ailesi C'ye aittir.

Eksonükleaz Aktivitesi

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1, hem 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesine hem de 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesine sahiptir.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3 sadece 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesine sahiptir.

İşlev

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1, RNA primerini 5' ila 3' yönünden uzaklaştırır.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3, 3' ucuna deoksiribonükleik asitler ekler.

RNA Primeri

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1, RNA primerini çıkarır.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3, DNA'yı sentezlemek için bir RNA primeri gerektirir.

DNA Sentezi

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1, büyüyen polinükleotid zincirine nükleotidler ekler.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3, prokaryotlarda DNA sentezlemek için anahtar enzimdir.

Gecikmeli/Öncü Teller

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1 sadece gecikmeli iplik üzerinde etki eder.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3, replikasyon çatalının hem önde gelen hem de geride kalan zincirlerine etki eder.

DNA Sentez Hızı

DNA Polimeraz 1: DNA polimeraz 1, saniyede 10 ila 20 nükleotid ekleyebilir.

DNA Polimeraz 3: DNA polimeraz 3, saniyede yaklaşık 1000 nükleotit ekleyebilir.

Çözüm

DNA polimeraz 1 ve 3, prokaryotik DNA replikasyonunda yer alan iki tip DNA polimerazdır. Her iki DNA polimeraz türü de 5 'ila 3' polimerizasyon aktivitesine sahiptir. Ek olarak, her iki enzim de düzeltme okuması için 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesine sahiptir. DNA polimeraz 3'ün ana işlevi, polimerizasyondaki işlevidir. Bununla birlikte, DNA polimeraz 1, 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesine sahiptir. 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesi ile DNA polimeraz 1, primer çıkarma yeteneğine sahiptir. Oluşturma boşluğu da DNA polimeraz 1 tarafından doldurulur. Bu nedenle, DNA polimeraz 1 ve 3 arasındaki temel fark, prokaryotik DNA replikasyonundaki rolleridir.

Referans:

1. “DNA Polimeraz I.” Worthington Enzim Kılavuzu. N.p., n.d. Ağ. Burada mevcut. 09 Ağustos 2017. 2. Marians, Kenneth J., Hiroshi Hiasa ve Deok Ryong Kim. “Çekirdek DNA Polimeraz III Alt Birimlerinin Çoğaltma Çatalındaki Rolü α İŞLEMSEL ÇOĞALTMA İÇİN GEREKLİ OLAN TEK ALT BİRİMDİR.” Biyolojik Kimya Dergisi. N.p., 23 Ocak 1998. Web. Burada mevcut. 09 Ağustos 2017.

Görünüm inceliği:

1. “Polimeraz Etki Alanları” (bilinmeyen) “Ayın Molekülü”, Mart 2000 – Commons Wikimedia2 aracılığıyla Protein Veri Bankası (Public Domain). "DNA polimeraz III (alt birimlerle)" Alepopoli'den - Commons Wikimedia aracılığıyla kendi çalışması (CC BY-SA 3.0)