Ana Fark - Endonükleaz ve Eksonükleaz

Nükleazlar, hem DNA hem de RNA olmak üzere nükleik asitlerdeki nükleotitler arasındaki fosfodiester bağlarını parçalayan bir hidrolaz sınıfıdır. Nükleazlar, üzerinde çalıştıkları substrat nükleik asidinin tipine göre iki tipe ayrılabilir: ribonükleazlar ve deoksiribonükleazlar. Ribonükleazlar RNA üzerinde çalışırken deoksiribonükleaz DNA üzerinde çalışır. Nükleazlar ayrıca endonükleazlar ve eksonükleazlar olarak ikiye ayrılabilir. NS asıl fark endonükleazlar ve eksonükleazlar arasındaki endonükleaz, nükleik asit ipliklerini ortadan ayırırken, eksonükleaz, nükleik asit ipliklerini uçlardan ayırır. Nükleazların hücre içindeki ana rolü, DNA onarım mekanizmalarında yer almaktır.

Kapsanan Kilit Alanlar

1. Endonükleaz nedir - Tanım, Özellikler, İşlev 2. Eksonükleaz nedir - Tanım, Özellikler, İşlev 3. Endonükleaz ve Eksonükleaz Arasındaki Benzerlikler Nelerdir? - Ortak Özelliklerin Anahatları 4. Endonükleaz ve Eksonükleaz Arasındaki Fark Nedir? – Temel Farklılıkların Karşılaştırılması

Anahtar Terimler: DNA, DNA onarımı, Endonükleaz, Ekzonükleaz, Kısıtlama Endonükleazları, Kısıtlama Bölgesi, RNA

Endonükleaz nedir

Bir endonükleaz, nükleik asitleri ortasından parçalayan bir hidrolaz sınıfıdır. Endonükleazların etkisi, iki veya daha fazla nükleik asit fragmanı ile sonuçlanabilir. Endonükleazlar hem DNA hem de RNA üzerinde hareket etme yeteneğine sahiptir. Deoksiribonükleazlar (DNazlar) gibi bazı endonükleazların bölünmesi spesifik değildir. Bununla birlikte, birçok endonükleaz, hedef nükleotid dizilerini belirli bir şekilde parçalar. Bu tip spesifik endonükleazlara denir. kısıtlama endonükleazları. Nükleik asit zincirinin belirli bir dizisini tanıyabilirler. Bu nedenle, bu kısıtlama endonükleazları, spesifik nükleotid dizisini tarayarak, nükleik asit üzerindeki etkilerinden önce bir gecikme süresinden geçerler. Bu spesifik nükleotid dizisine kısıtlama bölgesi denir.

Şekil 1: Hind III'ün eylemi

Tipik bir kısıtlama bölgesi, dört ila altı nükleotitten oluşan bir palindromik dizidir. Pek çok restriksiyon endonükleazı, DNA ipliklerini parçalayarak tek iplikli uçlar bırakır. yapışkanlı sonlar. Genetik mühendisliğinde, bu tip kısıtlama endonükleazları, farklı, istenen DNA zincirlerini birbirine bağlayarak rekombinant DNA üretmek için yaygın olarak kullanılır. Daha yüksek organizmalarda DNA metilasyonu, endonükleazların genomları üzerindeki etkisini engeller. Bununla birlikte, prokaryotik DNA, metilasyondan yoksundur. Bu nedenle, ökaryotik bir konakçı içindeki prokaryotik DNA, bölünme için kolayca hedeflenebilir. Kısıtlama endonükleazının, Hin d III'ün etkisiyle yapışkan uç oluşumu, şekil l'de gösterilmektedir.

Eksonükleaz nedir

Bir eksonükleaz, nükleik asit zincirini sonunda parçalayan bir tür hidrolazdır. Eksonükleazlar, fosfodiester bağlarını 3' veya 5' uçlarında hidrolize ederek nükleotitleri tek tek nükleik asit zincirinden uzaklaştırır. Hem prokaryotlarda hem de ökaryotlarda üç tip eksonükleaz tanımlanabilir. Bunlar 5' ila 3' eksonükleaz, 3' ila 5' eksonükleaz ve poli (A)'ya özgü 3' ila 5' eksonükleazlardır. Her üç türün de mRNA döngüsünde rolü vardır. Prokaryotik DNA replikasyonu sırasında büyüyen zincire nükleotidlerin eklenmesini katalize eden E.coli DNA polimeraz III, ε alt biriminde 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesinden oluşur. ε alt birimi, büyüyen zincirin sonundan yanlış eşleştirilmiş nükleotidleri çıkarır.

Şekil 2: DNA polimeraz I'in 3' ila 5' eksonükleaz alanı

DNA polimeraz III'ün 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesi, enzimin düzeltme okuma aktivitesi olarak adlandırılır. DNA polimeraz I, hem 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesine hem de 3' ila 5' eksonükleaz aktivitesine sahiptir. 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesi, bir seferde on nükleotidi kaldırabilir. Eksonükleazlar, DNA düzeltme okumasında, DNA onarımında ve DNA stabilizasyonunda hayati bir rol oynar. DNA polimeraz I'in 3' ila 5' eksonükleaz alanı, şekil 2'de gösterilmektedir.

Endonükleaz ve Eksonükleaz Arasındaki Benzerlikler

Endonükleaz ve Eksonükleaz Arasındaki Fark

Tanım

endonükleaz: Endonükleaz, iki uç dışındaki nükleotitleri ayıran polinükleotit zincirini parçalayan bir enzimi ifade eder.

eksonükleaz: Ekzonükleaz, nükleotitleri tek tek çıkararak polinükleotit zincirini zincirin sonundan ayıran bir enzimi ifade eder.

Hareket mekanizması

endonükleaz: Endonükleazlar, nükleik asitleri nükleik asitlerin ortasında parçalar.

eksonükleaz: Eksonükleazlar, uçlarında nükleik asitleri parçalar.

Gerileme anı

endonükleaz: Kısıtlama endonükleazları, aktivitelerinden önce bir gecikme süresinden geçer.

eksonükleaz: Eksonükleaz, aktivitelerinden önce bir gecikme süresine sahip değildir.

Sonuçlar

endonükleaz: Endonükleazlar, oligonükleotitlerle sonuçlanır.

eksonükleaz: Eksonükleazlar, tek nükleotidler veya nükleositler ile sonuçlanır.

Kör/Yapışkan Uçlar

endonükleaz: Endonükleazlar, kör uçlar veya yapışkan uçlar oluşturabilir.

eksonükleaz: Eksonükleazlar yapışkan uçlar oluşturur.

rol

endonükleaz: Endonükleazlar patojenlerin girişini engeller.

eksonükleaz: Eksonükleazların patojenlerin girişini engellemede önemli bir rolü yoktur.

Örnekler

endonükleaz: DNazlar, S1 nükleaz ve Bam H1, Hin d III ve Eco RI gibi kısıtlama enzimleri endonükleazların örnekleridir.

eksonükleaz: Yılan zehiri, dalak fosfodiesteraz, DNA polimeraz III'ün 3' ila 5' eksonükleaz alanı, 5' ila 3' eksonükleaz aktivitesi ve DNA polimeraz I'in 3' ila 5' eksonükleaz alanı, ekzonükleazların örnekleridir.

Çözüm

Endonükleazlar ve eksonükleazlar, nükleotitler arasındaki fosfodiester bağlarını hidrolize ederek nükleik asitleri parçalayan iki tip nükleazdır. Endonükleazlar polinükleotid zincirini ortadan, eksonükleazlar ise polinükleotid zincirini uçlardan parçalar. Kısıtlama endonükleazları, polinükleotit zincirini belirli bir dizide parçalayan bir tür endonükleazdır. Eksonükleazlar, kopyalanmış DNA'nın yeniden okunmasında önemlidir. Bununla birlikte, endonükleaz ve eksonükleaz arasındaki temel fark, polinükleotit zincirinin bölünme yeridir.

Referans:

1. McMahon, Mary ve O. Wallace. "Endonükleaz nedir?" WiseGEEK. Conjecture Corporation, 04 Temmuz 2017. Web. Burada mevcut. 08 Ağustos 2017. 2. “Eksonükleaz.” Vikipedi. Wikimedia Foundation, 01 Ağustos 2017. Web. Burada mevcut. 08 Ağustos 2017.3. Lodos, Harvey. "DNA Çoğaltma Makineleri." Moleküler Hücre Biyolojisi. 4. baskı.ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 01 Ocak 1970. Web. Burada mevcut. 08 Ağustos 2017.

Görünüm inceliği:

1. "HindIII Kısıtlama sitesi ve yapışkan uçlar vektörü" Helixitta tarafından - Commons Wikimedia2 aracılığıyla kendi çalışmanız (CC BY-SA 4.0). “Poli I yapısı” Christopherrussell - Gunther S, Rother K, Frommel C (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia aracılığıyla