Ana Fark - Genomik vs Proteomik

Genomik, proteomik ve metabolomik, canlıların genomlarına, genetik talimatlara göre sentezlenen protein ürünlerine ve metabolize ettikleri moleküllerin türüne göre sınıflandırılması ve çalışılmasıyla ilgili alanlardır. Genomik ve proteomik yakından ilişkili alanlardır. NS asıl fark genomik ve proteomik arasındaki genomik, bir hücrenin genomundaki tüm gen setinin incelenmesidir, proteomik ise hücre tarafından üretilen tüm protein setinin incelenmesidir.. Metabolomik ise, bir hücrenin enzimatik reaksiyonlarının substratları ve yan ürünleri olarak hizmet eden düşük moleküler ağırlıklı bileşiklerin tamamının incelenmesidir.

Kapsanan Kilit Alanlar

1. Genomik Nedir? - Tanım, Teknikler, Sınıflandırma 2. Proteomik Nedir? - Tanım, Teknikler, Sınıflandırma 3. Genomik ve Proteomik Arasındaki Benzerlikler Nelerdir? - Ortak Özelliklerin Anahatları 4. Genomik ve Proteomik Arasındaki Fark Nedir? – Temel Farklılıkların Karşılaştırılması

Anahtar Terimler: Genler, Genomik, İnsan Genom Projesi (HGP), İnsan Proteom Projesi (HPP), Proteinler, Proteom, Proteomik

Genomik nedir

Genomik, bir genomdaki tüm gen setinin çalışmasını ifade eder. Genom, esas olarak DNA'dan oluşan bir organizmanın genetik bilgi setinin tamamıdır. Genomikte genomları haritalamak, sıralamak ve analiz etmek için yüksek verimli teknikler kullanılır. Genomikle ilgili teknikler, yönlendirilmiş gen dizilimi, tüm genom pompalı tüfek dizilimi, eksprese edilmiş dizilim etiketlerinin (EST'ler), tek nükleotid polimorfizmlerinin (SNP'ler) tanımlanması gibi gen dizileme stratejilerini ve farklı yazılım ve veritabanları. Av tüfeği sıralamasının ana adımları şekil 1'de gösterilmektedir.

Şekil 1: Çevresel Av Tüfeği Sıralaması (ESS)Örnekleme, (B) Parçacıkların Filtrelenmesi, (C) DNA Ekstraksiyonu ve Parçalanması, (D) Klonlama ve Kitaplık, (D) Dizileme, (E) Dizi Montajı

Genomiklerin iki ana alanı yapısal genomik ve fonksiyonel genomiktir. İçinde yapısal genomik, genlerin yapısı ve göreli konumları incelenirken fonksiyonel genomik, metabolik aktivitelerin düzenlenmesinde genlerin işlevi veya rolü incelenir. Genom Dizileme Projeleri, genomikteki en son gelişmedir. İnsan Genom Projesi (HGP) 2003 yılında tamamlandı. İnsan Genom Projesi'nin hedefleri şunlardı:

İnsan genomunun yanı sıra fare ve pirinç genomları da genomik çalışmalara tabi tutulmuştur.

Proteomik Nedir?

Proteomik, bir hücre tarafından üretilen tüm protein setinin çalışmasını ifade eder. Proteom, hücre tarafından üretilen eksiksiz protein setidir. Proteomikte, 3B yapının karakterizasyonu ve proteinlerin işlevi, yüksek verimli yöntemler kullanılarak gerçekleştirilir. Proteomik ile ilgili teknikler, proteinlerin ekstraksiyonu ve elektroforetik olarak ayrılması, tripsin kullanımı ile proteinlerin küçük parçalara bölünmesi, kütle spektrometrisi ile amino asit dizisinin belirlenmesi ve protein veri tabanlarındaki bilgiler kullanılarak proteinlerin tanımlanmasını içerir. Ayrıca, yazılım tabanlı yöntemler kullanılarak proteinin 3 boyutlu yapısı tahmin edilebilir. Proteinlerin ekspresyonu, protein mikrodizileri ile incelenebilir. Protein-protein etkileşimlerini belirlemek için protein-ağ haritaları geliştirilebilir. Farklı proteomik fenomenleri şekil 2'de gösterilmektedir.

Şekil 2: Proteomik

İnsan genomunun genlerinin protein ürünleri, İnsan Proteom Projesi (HPP) sırasında incelenir. İnsan Proteom Projesi'nin temel amaçlarından biri, başlıca hastalıklarda yer alan proteinleri belirlemektir.

Genomik ve Proteomik Arasındaki Benzerlikler

Genomik ve Proteomik Arasındaki Fark

Tanım

Genomik: Genomik, bir genomdaki tüm gen setinin çalışmasını ifade eder.

Proteomik: Proteomik, bir hücre tarafından üretilen tüm protein setinin çalışmasını ifade eder.

olaylar

Genomik: Genomik, genomların haritalanmasını, sıralanmasını ve analizini içerir.

Proteomik: Proteomik, proteinlerin 3B yapısını ve işlevini ve protein-protein etkileşimlerini içerir.

sınıflandırma

Genomik: İki tür genomik, yapısal genomik ve fonksiyonel genomiktir.

Proteomik: Üç tip proteomik, yapısal, fonksiyonel ve ekspresyon proteomikleridir.

Önemli Alanlar

Genomik: İnsan Genom Projesi gibi genom dizileme projeleri, genom biliminin önemli alanlarıdır.

Proteomik: SWISS-2DPAGE gibi proteom veritabanı geliştirmeleri ve bilgisayar destekli ilaç tasarımı için yazılım geliştirme, proteomiklerin önemli alanlarıdır.

Çözüm

Genomik ve proteomik, organizmaların çalışmasında kullanılan iki bilimsel alandır. Genomik, bir organizmadaki tüm gen setinin incelenmesidir, proteomik ise hücre tarafından üretilen tüm protein setinin incelenmesidir. Genomik ve proteomik arasındaki temel fark, organizmaların incelenmesi sırasında her alanın kriterleridir.

Referans:

1. Griffiths, Anthony JF. "Genomik: genel bir bakış." Genetik Analize Giriş. 7. baskı., U.S. National Library of Medicine, 1 Ocak 1970, Buradan ulaşabilirsiniz.2. Sınırsız. "Genomik ve Proteomik." Genomik ve Proteomik | Sınırsız Biyoloji, Buradan ulaşabilirsiniz.3. Graves, Paul R. ve Timothy A.J. Haystead. "Moleküler Biyologun Proteomik Rehberi." Microbiology and Molecular Biology Reviews, American Society for Microbiology, Mart 2002, Buradan ulaşabilirsiniz.

Görünüm inceliği:

1. “Çevresel av tüfeği dizilimi” John C. Wooley, Adam Godzik, Iddo Friedberg - (CC BY 2.5) Commons Wikimedia2 aracılığıyla. “Proteomik” Xxl7441'den İngilizce Vikikitap'ta – en.wikibooks'tan Commons'a aktarılmıştır. (Kamusal Alan) Commons Wikimedia aracılığıyla