Proteinler, yaşamın devamı için gerekli bir kimyasal makromolekül grubudur. Vücudumuzun metabolik fonksiyonlarının çoğunda yer alırlar ve esas olarak amino asitlerden yapılırlar. Bu makale araştırıyor,

1. Proteinler ve Amino Asitler Arasındaki İlişki

2. Amino Asitlerden Proteinler Nasıl İnşa Edilir?

3. Peptit Bağları

Proteinler ve Amino Asitler Arasındaki İlişki Nedir?

Her protein belirli bir işlev için yapılır ve işlevleri esas olarak genellikle 'protein katlama' olarak adlandırılan 3B yapılarına bağlıdır. Proteinler, amino asit dizilerine bağlı olarak birbirlerinden farklıdır. Bu nedenle amino asitler proteinlerin ana yapı taşlarıdır. Proteinlerin sentezinde 22 amino asit kullanılır ve bunlar 'proteinojenik' amino asitler veya doğal amino asitler olarak bilinirler. Diğerlerine proteinojenik olmayan amino asitler denir.

Amino Asitlerden Proteinler Nasıl Yapılır?

Yukarıda belirtildiği gibi, Proteinler bir makromolekül sınıfıdır. Bir makromolekül, büyük, polimerize bir varlıktır. Bir polimer, monomer adı verilen tek birimlerden yapılır. Bu nedenle, proteinlerin monomerleri amino asitlerdir. Amino asitler, peptit zincirleri adı verilen daha uzun zincirler oluşturmak için farklı dizilerde birleşebilir. Amino asitler zincir uzantılarında birbirleriyle birleştiklerinde oluşturdukları bağ tipine esasen bir amid bağı olan peptit bağı denir. yani (-[C=O]-NH-)

Bir amino asidin temel yapısı, merkezi Karbon atomunun etrafındaki ana gruplardan oluşur. Bu gruplar arasında bir karboksilik asit grubu (-COOH), bir amin grubu (-NH₂), bir alkil grubu (R) ve bir Hidrojen atomu. Peptid zincirlerinin oluşumu için zincir uzaması gerçekleştiğinde, amin grubu ve karboksilik asit grubu kendilerini uçtan uca bir şekilde hizalarlar. Bir amino asidin karboksilik grubu, peptit bağları adı verilen amid bağlarını oluşturmak için başka bir amino asidin amin grubu ile reaksiyona girer. Amino asitler, yan zincir olarak görev yapan alkil gruplarının yapısına göre birbirlerinden farklılık gösterirler; merkezi karbon atomunun etrafındaki diğer üç grup, tüm amino asitler için ortaktır. Ayrıca 22 proteinojenik amino asitten 9 tanesi insan vücudu tarafından başka bileşikler kullanılarak sentezlenemediği için esansiyel amino asitler olarak tanımlanmıştır.

Peptit Bağları Nelerdir?

Yukarıda bahsedildiği gibi, bir peptit bağı, proteinlerin oluşumunda amino asitler arasındaki ana reaksiyondur. Bununla birlikte, protein oluşumu çok aşamalı bir süreçtir. Bireysel amino asitler, peptit zincirleri oluşturmak için peptit bağları yoluyla diğer amino asitlerle birleşir. Polipeptit zincirleri, birkaç peptit zinciri etkileşime girdiğinde oluşur. Bu polipeptit zincirleri, proteinlerin farklı 3B konformasyonlara doğal olarak katlanmasına yol açan, birbirleriyle benzersiz fiziksel moleküller arası etkileşimler oluşturur. Bu katlanma, her protein için ona kimliğini veren bir parmak izi görevi görür.

İki amino asit bir peptit bağı oluşturmak üzere reaksiyona girdiğinde ortaya çıkan birime dipeptit denir. Bu tek birim reaksiyona yoğuşma reaksiyonu denir. Bir amino asidin karboksilik asit grubu (-COOH), amin grubu (-NH) ile reaksiyona girdiğinde₂) başka bir amino asitten, bir su molekülünün salınmasıyla bir amid bağı/peptid bağı oluşur. Bu yoğunlaşma reaksiyonu enerji tüketir ve gerekli enerji insan hücrelerinde üretilen ATP tarafından elde edilir.

Görünüm inceliği:

“Peptidformationball” GYassineMrabet tarafından Bu vektör görüntüsü Inkscape ile oluşturulmuştur. – Commons Wikimedia aracılığıyla kendi eseriniz (Public Domain)