NS asıl fark uyumsuzluk onarımı ve nükleotid eksizyon onarımı arasındaki uyumsuzluk onarımı (MMR), DNA replikasyonu sırasında ortaya çıkan baz uyumsuzluklarının ve küçük ekleme/silme döngülerinin giderilmesinden sorumluyken, nükleotid eksizyon onarımı (NER), ultraviyole radyasyon nedeniyle meydana gelen çeşitli DNA hasarlarının giderilmesinden sorumludur. Ayrıca, hücreler DNA sentezinden hemen sonra uyumsuzluk onarımına girerken, DNA hasar görürse hücreler nükleotit eksizyon onarımına tabi tutulur.

Uyumsuzluk onarımı ve nükleotid eksizyon onarımı, DNA dizisindeki mutasyonları ve diğer kalıcı değişiklikleri önleyen iki mekanizmadır.

DNA Hasarı, DNA Onarımı, Uyumsuzluk Onarımı (MMR), Nükleotid Eksizyon Onarımı (NER), Replikasyon Hataları

Uyuşmazlık Onarımı Nedir?

Uyuşmazlık onarımı (MMR), DNA replikasyonundan hemen sonra meydana gelen bir DNA onarım mekanizmasıdır. Bu nedenle, bu mekanizmanın temel amacı, düzeltme okuması ile düzeltilmeyen hatalı eşleştirilmiş bazları çıkarmak ve değiştirmektir. Ayrıca DNA polimerazın kaymaları nedeniyle oluşan küçük ekleme ve delesyonları tespit eder ve düzeltir.

Şekil 1: Uyuşmazlık Onarım Mekanizması

Genellikle, E. coli uyumsuzluk onarım sistemindeki üç protein MutS, MutL ve MutH'dir. Öte yandan, ökaryotlar sadece MutS ve MutL'nin homologlarını içerir. İnsanlarda MutS-homolog heterodimer, MSH2-MSH6 uyumsuzluğa bağlanırken MSH2-MSH6 ve MSH2-MSH3, ekleme/silme döngüsüne bağlanabilir. Ardından, yeni sentezlenen iplik, EXO1'in eylemiyle uyumsuzluğu ortadan kaldırarak bozulur. Bundan sonra, DNA'nın yeniden sentezi ve ligasyon uyumsuzluğu tamamlar.

Nükleotid Eksizyon Onarımı Nedir?

Nükleotid eksizyon onarımı (NER), hasarlı nükleotitleri çıkarmak ve değiştirmek için bir DNA onarım mekanizmasıdır. Genellikle bu mekanizma, DNA çift sarmalını bozan DNA hasarlarını tespit eder ve düzeltir. Yani; bu yol, nükleotidleri tespit eder ve sigara dumanındaki kimyasallar gibi DNA'ya bağlı büyük kimyasal gruplarla değiştirir. Ayrıca, nükleotid eksizyon onarım yolu, UV radyasyonunun neden olduğu DNA hasarlarını düzeltir. Burada UV radyasyonu, timin ve sitozin bazlarının bitişik nükleotitleriyle reaksiyona girmesini sağlar. Bununla birlikte, ortaya çıkan bağlar çift sarmalı bozarak DNA replikasyonunda hatalara neden olur. Burada, bu bağların en yaygın türü, birlikte reaksiyona giren iki timin nükleotidinden oluşan timin dimerleridir.

Şekil 2: Nükleotid Eksizyon Onarımı

Uyumsuzluk Onarımı ve Nükleotid Eksizyon Onarımı Arasındaki Benzerlikler

Uyumsuzluk Onarımı ve Nükleotid Eksizyon Onarımı Arasındaki Fark

Tanım

Uyuşmazlık onarımı (MMR), bir uyumsuz baz çiftinin bir üyesinin normal olarak eşleşen baza dönüştürüldüğü bir DNA onarım sistemine atıfta bulunurken, nükleotit eksizyon onarımı (NER), memeliler tarafından bu tür hacimli DNA lezyonlarını çıkarmak için kullanılan ana yola atıfta bulunur. UV ışığı ile oluşturulur.

Önemi

Hücreler, DNA sentezinden hemen sonra uyumsuzluk onarımına girerken, hücreler, DNA hasarlarının meydana gelmesiyle nükleotit eksizyon onarımına maruz kalır.

Onarım Türü

Uyumsuzluk onarımı, düzeltme okuması ile tamir edilmeyen uyumsuzlukların ve ekleme/silme döngülerinin yerini alırken, nükleotid eksizyon onarımı, sigara dumanındaki UV radyasyonu veya kimyasalların oluşturduğu DNA hasarlarının yerini alır.

tarafından eksizyon

Ekzonükleaz 1, uyumsuzluk onarım mekanizmasındaki uyumsuz DNA'yı keserken, transkripsiyon faktörleri, XPG ve XPF-ERCC1, nükleotit eksizyon onarım mekanizmasındaki hasarlı DNA'yı keser.

Çözüm

Uyumsuzluk onarımı, DNA replikasyonu sırasında dahil edilen uyumsuzlukların ve ekleme/silme döngülerinin yerini alan DNA onarım mekanizmasıdır. Genellikle, bu uyumsuzluklar, düzeltme okuması sırasında kaçanlardır. Öte yandan, nükleotid eksizyon onarımı, hasarlı DNA'yı UV radyasyonu ile değiştiren başka bir DNA onarımı mekanizmasıdır. Bu nedenle, yanlış eşleşme onarımı, DNA replikasyonundan hemen sonra gerçekleşir. Ancak DNA hasarlarının oluşması ile nükleotid eksizyon onarım mekanizmaları ortaya çıkar. Her iki mekanizmanın da temel işlevi, DNA'daki mutasyonları ve diğer kalıcı değişiklikleri önlemektir. Bu nedenle, uyumsuzluk onarımı ile nükleotid eksizyon onarımı arasındaki temel fark, onarımın türüdür.

Referanslar:

1. Fleck, O. “DNA Onarımı.” Hücre Bilimi Dergisi, cilt. 117, hayır. 4, 2004, s. 515–517., doi:10.1242/jcs.00952.

Görünüm inceliği:

1. “DNA uyumsuzluğu onarımı Ecoli” Kenji Fukui (CC BY 4.0) aracılığıyla Commons Wikimedia aracılığıyla 2. “Nucleotide Excision Repair-journal.pbio.0040203.g001” Jill O. Fuss, Priscilla K. Cooper (CC BY 2.5) aracılığıyla Commons Wikimedia