NS asıl fark gen nakavt ve nakavt arasında gen nakavt, hedef genlerin tamamen silinmesini veya anlamsız mutasyonlar yoluyla etkisiz hale getirilmesini içerirken, gen nakavt, abortif protein translasyonuna ve bu mRNA'nın bozulmasına yol açar.. Ayrıca, gen nakavt DNA düzeyinde uygulanabilirken gen nakavt RNA düzeyinde uygulanabilir.

Gen nakavt ve gen nakavt, organizmaların içindeki genlerin ifadesini susturmanın iki mekanizmasıdır.

CRISPR/Cas9, Endonükleazlar, Gen Knockdown, Gen Knockout, Gen Susturma, Saçma Mutasyon, RNAi

Gen Knockout nedir

Gen nakavt, genin genomdan tamamen silinmesinden veya gen dizisine çerçeve kayması mutasyonları veya durdurma kodonlarının eklenmesiyle anlamsız mutasyonlar yoluyla genin etkisizleştirilmesinden sorumlu bir gen susturma laboratuvar tekniğidir. Genin planı yok edildiğinden, hedef gen ürünü de ablasyona uğrar. Yöntem orijinal olarak homolog rekombinasyon ile geliştirilmiştir. İstenilen mutasyonu içeren bir DNA yapısının teslimini içerir. Daha sonra bu yapı, gen dizisini genomdan tamamen çıkararak hedef gen ile yeniden birleştirilir.

Şekil 1: Gen Knockout

Ek olarak, bölgeye özgü nükleazlar ZFN ve TALEN gibi genleri nakavt etmek için kullanılabilir. Hedef DNA dizisine oldukça spesifik bir şekilde bağlanırlar ve gen düzenlemenin etkinliğini arttırırlar. Öte yandan, CRISPR/Cas9 sistem, gen nakavt için kullanılabilen bir genom düzenleme yöntemidir.

Gen Knockdown nedir?

Gen yıkımı, belirli bir gen ürününün geçici olarak etkisizleştirilmesinden sorumlu olan başka bir gen susturma yöntemidir. RNA seviyesinde uygulanabilir ve hedef genin transkripsiyonu ile üretilen mRNA'yı hedefler. Bu nedenle, gen yıkımı, gen ekspresyonunun transkripsiyon sonrası düzenlenmesinin bir şeklidir.

Şekil 2: gen Knockdown

Belirgin bir şekilde, esas olarak RNA enterferansına dayanmaktadır (RNAi) yolu, mRNA'nın bozulmasına izin vererek. Burada miRNA, siRNA ve shRNA, hedef mRNA'ya bağlanarak kilit bir rol oynar. Elde edilen RNA dupleksleri, Dicer ve RISC'nin etkisi ile bozulur. İlgilenilen genin ifadesini geçici olarak kapatacaklar.

Gen Knockout ve Gen Knockdown Arasındaki Benzerlikler

Gen Knockout ve Gen Knockdown Arasındaki Fark

Tanım

Gen nakavt, organizmanın DNA'sının manipüle edilmesinin neden olduğu bir genin fonksiyon kaybına yol açan DNA'da kalıcı bir değişikliği ifade ederken, gen nakavt, deneysel bir tekniğin neden olduğu gen ekspresyonunda, genellikle bir antisens oligo'nun neden olduğu geçici bir azalmayı ifade eder. Dolayısıyla, gen nakavt ve nakavt arasındaki temel fark budur.

Önem

Gen nakavt ve nakavt arasındaki temel fark, gen nakavtının hedef genlerin tamamen silinmesini veya anlamsız mutasyonlar yoluyla etkisiz hale getirilmesini içerirken, gen nakavtının abortif protein translasyonuna ve bu mRNA'nın bozulmasına yol açmasıdır.

Etki

Ayrıca, gen nakavt, kalıcı bir gen susturma yöntemi iken, gen nakavt, geçici bir gen susturma yöntemidir.

Etkili Seviye

mekanizmalar

Homolog rekombinasyon, endonükleazlar ve CRISPR/Cas9, gen nakavt için çeşitli mekanizmalardır, RNA etkileşimi ise gen yıkımı için ana mekanizmadır. Dolayısıyla, bu aynı zamanda gen nakavt ve nakavt arasındaki önemli bir farktır.

Çözüm

Gen nakavt, DNA düzeyinde uygulanabilen bir gen susturma yöntemidir. Hedef genin tamamen silinmesinden veya anlamsız mutasyonlar yoluyla etkisiz hale getirilmesinden sorumludur. Buna karşılık, gen yıkımı, RNA düzeyinde uygulanabilen bir gen susturma yöntemidir. MRNA'yı bozarak gen ekspresyonunun geçici olarak inaktivasyonundan sorumludur. Bu nedenle, gen nakavt ve nakavt arasındaki temel fark, gen susturma mekanizmasıdır.

Referanslar:

1. Davis, ED. "TALEN veya CRISPR tarafından Nakavt vs. ShRNA veya SiRNA tarafından Knockdown." Genecopoeia, GeneCopoeia, Inc., 2014, Burada Bulunmaktadır.

Görünüm inceliği:

1. “Frameshift mutasyonları (13080927393)” Genomik Eğitim Programı tarafından – Commons Wikimedia aracılığıyla Frameshift mutasyonları (CC BY 2.0) 2. “RNA enterferansı mekanizması” Simone Mocellin ve Maurizio Provenzano tarafından – RNA enterferansı: hücre fizyolojisinden gen yıkımını öğrenme doi:10.1186/1479-5876-2-39 (CC BY 2.0) Commons Wikimedia aracılığıyla