Ana Fark - Polipeptit ve Protein

Polipeptitler ve proteinler, amino asitlerin polimerleridir. Amino asitler, bir amin grubu, karboksil grubu, bir hidrojen atomu ve aynı karbon atomuna bağlı bir alkil grubundan oluşan organik bileşiklerdir. Amino asitler, polipeptitler ve proteinler oluşturmak için peptit bağları yoluyla birbirine bağlanır. Bir peptit bağı, bir su molekülünü ortadan kaldırarak iki amino asidin yoğunlaşmasıyla yapılan kovalent bir bağdır. Bu su molekülü, bir amino asidin amino grubundan bir hidrojen atomu ile diğer amino asidin karboksil grubunun hidroksil grubunun birleşmesiyle oluşur. Peptitler kısa amino asit zincirleridir. Polipeptitler, uzun amino asit zincirleridir. Proteinler iki veya daha fazla polipeptit zincirinden üretilir. Hem polipeptitler hem de proteinler biyolojik sistemlerde bulunabilir. Polipeptitler ve proteinler arasındaki temel fark şudur: polipeptitler, proteinlerden daha düşük moleküler ağırlığa sahiptir.

Kapsanan Kilit Alanlar

1. Polipeptit Nedir? - Tanım, Özellikler, Fonksiyonlar, Örnekler 2. Protein Nedir? - Tanım, Yapılar, Özellikler, Fonksiyonlar, Örnekler 3. Polipeptit ve Protein Arasındaki Fark Nedir? – Temel Farklılıkların Karşılaştırılması

Anahtar Terimler: Yoğunlaşma, Peptit, Peptit Bağları, Polimer, Polipeptit, Protein

Polipeptit Nedir?

Bir polipeptit, amino asitlerden yapılmış uzun dalsız bir zincirdir. Adından da anlaşılacağı gibi bir polipeptit, birkaç peptitten oluşan bir koleksiyondur. Bir peptit, kısa zincirli bir amino asit dizisidir. Bu nedenle, bir polipeptit, uzun zincirli bir amino asit dizisidir.

Amino asitler, bu uzun dalsız polipeptit zincirlerini oluşturmak için kovalent olarak bağlanır. Bu kovalent bağa peptit bağı denir. İki amino asit molekülü arasındaki yoğunlaşma reaksiyonundan bir peptit bağı oluşur. Burada bir amino asidin karboksil grubu, başka bir amino asidin amino grubu ile reaksiyona girer. Bu, karboksil grubunun -OH'sini ve bir amino grubundan H'yi birleştirerek bir su molekülünü ortadan kaldırır. O zaman ortaya çıkan bağ –CONH- bağı olacaktır. Bu nedenle, peptit bağlarının varlığını belirlemek için –CONH- bağlarının varlığını bulabiliriz.

Şekil 1: Peptit Bağının Oluşumu

Polipeptitler proteinleri oluşturmak için kullanılır. Bir protein, bir veya daha fazla polipeptit zincirinden oluşabilir. Bu nedenle bir proteinin birincil yapısı, dallanmamış bir polipeptit zinciridir. Biyolojik sistemlerde hem küçük hem de büyük polipeptit zincirleri bulabiliriz. Örneğin, çoğu omurgalı hormonu insülin, glukagon, kortikotropin vb. gibi küçük polipeptitlerdir.

Protein Nedir?

Bir protein, çok sayıda amino asitten oluşan karmaşık bir yapıdır. Amino asitler, polipeptit zincirleri oluşturmak için birbirine bağlanır. Bu zincirler bir protein oluşturmak için birleşebilir. Proteinler, yüksek moleküler ağırlığa sahip çok büyük ve karmaşık moleküllerdir. Bir proteinin düzenlenmesinin dört seviyesi vardır.

Şekil 2: Protein Yapılarının Dört Seviyesi

Protein Yapılarının Düzeyleri

Birincil yapı

Bir proteinin birincil yapısı basitçe uzun bir polipeptit zinciridir. Bu zincirde bulunan amino asitler arasında sülfit bağları olabilir.

ikincil yapı

Bir proteinin ikincil yapısı, iyi sıralanmış, katlanmış bir yapı (spiral bir yapı) olduğu için alfa sarmal yapısı olarak bilinir. Bazen anti-paralel beta pileli yapı adı verilen ikincil yapılar vardır. Burada polipeptit zincirleri, beta kıvrımlı bir tabaka gibi düzenlenir.

Üçüncül Yapı

Üçüncül yapı, birincil yapı ve ikincil yapıdan daha karmaşık bir yapıdır. 3 boyutlu bir yapıdır. Bu yapı, polipeptit zincirlerinin disülfid bağları, iyonik bağlar, Van Der Waal bağları ve hidrojen bağları yoluyla birleşiminden oluşur.

Kuaterner yapı

Kuaterner yapı, birkaç alt birimden veya polipeptitten oluşur. Burada, bu alt birimleri bir arada tutmak için hidrofobik etkileşimler kullanılır. Bunun için iyi bir örnek Hemoglobin'dir.

Polipeptit ve Protein Arasındaki Fark

Tanım

polipeptit: Bir polipeptit, amino asitlerden yapılmış uzun dalsız bir zincirdir.

Proteinler: Bir protein, çok sayıda amino asitten oluşan karmaşık bir yapıdır.

alt birimler

polipeptit: Amino asitlerden polipeptitler oluşur.

Proteinler: Proteinler polipeptitlerden yapılır.

Moleküler ağırlık

polipeptit: Bir polipeptidin moleküler ağırlığı, bir proteininkinden daha düşüktür.

Proteinler: Bir proteinin moleküler ağırlığı, bir polipeptitten daha yüksektir.

Kimyasal Yapıştırma

polipeptit: Polipeptitler, peptit bağlarından oluşur.

Proteinler: Proteinler, peptit bağları, disülfid bağları, iyonik bağlar ve Van Der Waal çekicilikleri gibi çeşitli bağ türlerinden oluşur.

Çözüm

Hem polipeptitler hem de proteinler, amino asitlerden oluşan organik bileşiklerdir. Bunlar amino asit monomerlerinden yapılmış polimerler olarak sınıflandırılır. Bu amino asitler birbirine peptit bağları ile bağlanır. Polipeptit ve protein arasındaki temel fark, polipeptitlerin proteinlerinkinden daha düşük moleküler ağırlığa sahip olmasıdır.

Referanslar:

1. Helmenstin, Ph.D. Anne Marie. “Protein Yapısının Dört Konformasyon Düzeyini Bilin.” ThoughtCo, Burada mevcut. Erişim tarihi: 14 Eylül 2017. 2. "Bölüm 5: Amino Asitler ve Peptitler." Bioinfo.org, Buradan ulaşabilirsiniz. Erişim tarihi: 14 Eylül 2017. 3. “Polipeptidler.” Biology-Pages.info, Buradan ulaşabilirsiniz. Erişim tarihi: 14 Eylül 2017.

Görünüm inceliği:

1. “224 Peptid Bond-01” OpenStax College – Anatomy & Physiology, Connexions Web sitesi. 19 Haziran 2013. (CC BY 3.0) Commons Wikimedia aracılığıyla 2. “Bir proteinin yapısal organizasyon düzeyleri” Scurran15 tarafından – Commons Wikimedia aracılığıyla kendi çalışmanız (CC BY-SA 4.0)